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染色质水相法分离实验操作步骤

染色质水相法分离实验:

实验材料 :细胞

试剂、试剂盒:水相裂解缓冲液        

仪器、耗材:离心机

实验步骤:

1. 收获细胞。

对于悬浮培养细胞(500 ml 培养基),室温 1500 g 离心 5 分钟收获细胞。在室温用聚胺缓冲液清洗三次所得到的沉淀,1500 g 离心 5 分钟收集细胞。

聚胺缓冲液:

15 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.4)

0.2 mmol/L 精胺

0.5 mmol/L 精咪

2 mmol/L EDTA

80 mmoI/L KCl

0.1 mmol/L PMSF(临用前从用 100% 乙醇制备的 1 mmol/L 的贮存液中加入)

像聚胺法的第 1、2 步中讲的那样诱导悬浮或单层培养细胞的中期阻遏状态。

2. 细胞在 4℃,1000 g 离心 10 分钟然后重悬浮,典型的制备量为 10 ml 新鲜培养基含 108 个细胞。

3. 将浓的细胞悬液在冰上放置至少 30 分钟冷却以帮助有丝分裂复合物的完全解离。

4. 4℃ 1000 r/min 离心 10 分钟沉淀细胞。

5. 沉淀用 10 ml 75 mmol/L 的 KCI 重悬浮,4℃ 孵育 20 分钟进行低渗溶胀。

6. 4℃ 1000 r/min 离心溶胀细胞。

7. 将细胞重悬浮于 10 ml 的水相裂解缓冲液中,温和揽拌,冰上放置 5 分钟。

水相裂解缓冲液:

10 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.4)

120 mmol/L KCl

20 mmol/L NaCl

0.1 % Triton X-100

含 2 mmol/L CaCl2 的 0.1 mmol/L PMSF

8. 将悬液温和地反复通过一 25 号皮下注射针头大约 10 次或用 Dounce 匀浆器破碎法使细胞完全裂解(避免产生气泡)。

9. 将破碎的细胞在 4℃ 400 g 离心 3 分钟去除细胞核,上清移至一干净的离心管中。

10. 4℃ 3000 g 离心上清 15 分钟以浓缩染色体。  

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